Дело в том, что классификация пород была разработана для сельскохозяйственных животных – коров, лошадей, свиней, которые в своем естественном состоянии не являются синантропными, т. е. обитающими рядом с людьми. Кошки же, по крайней мере с античных времен, животные именно синантропные. Местные популяции кошек обычно никакому искусственному отбору не подвергаются. На них действует исключительно естественный отбор, но только весьма специфический за счет своеобразной среды их обитания. Не имеющий понятия о культуре племенного разведения владелец сибирского кота может гордиться своим любимцем, но отнюдь не станет подыскивать ему подходящую пару, а предоставит это занятие самому коту, выпустив его на улицу. Ну а кот тоже вряд ли будет подбирать себе супругу в соответствии со стандартом породы... В итоге уровень разнообразия животных в местных популяциях может быть весьма высоким.
В начале фелинологической работы в России энтузиасты первой отечественной породы столкнулись с тем фактом, что для большей части владельцев кошек наличия длинной шерсти у их питомцев было достаточно, чтобы именовать их сибирскими. Как показывают геногеографические исследования, распространенность аллеля длинной шерсти в районах восточной Сибири действительно весьма высока. Но такая же картина наблюдается и в северо-европейской части России, и на Черноморском побережье России и Украины. Так что первые представленные под названием сибирских кошки представляли собой довольно пеструю по экстерьеру группу. Наиболее распространенными недостатками среди этого поголовья были мелкие размеры, треугольная форма головы, слишком тонкая и суховатая текстура шерсти, слабо развитый подшерсток. Любопытной особенностью естественных популяций этих кошек был резкий половой диморфизм, т. е. коты были иногда в 2 – 3 раза крупнее, тяжелее и массивнее кошек.
Эта пестрота племенного материала усложнила выработку предварительного стандарта породы, без того затрудненную наличием двух близких по типу пород: норвежской лесной и американского мейн-куна.